赤字の公立病院が増加傾向にある。総務省によると、全国８４１の公立病院の２０２５年度決算は８１.２%が経常赤字だった。５年前の４２.８%からほぼ倍増した。
新型コロナウイルス禍では補助金の下支えにより、赤字病院の割合は２１年度に２７.６%まで低下していた。その後、補助金の縮小に加えて人件費や材料費の高騰などが重なり、赤字病院が増えた。２５年度は人事院勧告に準拠した賃上げによる給与費の増加と医薬品の価格上昇が重なった。
コロナ禍前の２０１９年度以前は赤字病院の割合は６割前後で推移していた。診療収入は増えているものの、費用の増加の勢いが上回っている。
経常収支をみると、２５年度は公立病院全体で３,３９９億円の赤字だった。物価高に対応した国庫補助金などの効果もあり、過去最大だった２４年度からは５５３億円縮小したが、１,２５５億円の黒字だった５年前に比べて厳しい経営環境が続く。
医業収益は救急患者の積極的な受け入れや診療単価の上昇により、前年度に比べて２.３%増の４兆7,９０４億円だった。医業費用は５兆９,２２５億円と３.４%増え、収益より伸び率が高かった。
医業費用のうち職員給与費は前年度比３.８%増えた。公立病院では人事院勧告に準拠して給与を改定するケースが多く、主に２５年度決算に反映される２５年勧告では平均３.６２%の引き上げとなった。地方では看護師や薬剤師の確保が難しく、人手不足も費用を押し上げた。
